BCDEdit - это тоже самое, что и MSConfig, т.е. редакторы "boot.ini". Если все дело в шеле и в выводе информации шелом, то ковыряйте чем удобнее.
И вопрос тогда нужно ставить корректнее.
За загрузку ядра отвечает - winload
А за загрузку системы - winlogon