Телепаты в отпуске, пожалуйста поподробнее. Что за файл, что за флешка?
А так, без подробностей -- в командной строке с правами администратора запустить команду chkdsk. Или то же самое через правую педаль мыши -- выполнить проверук с автоматическим исправлением всего что найдет. Ну и убедиться, что это не связано с деятельностью антивирусов.